最高人民检察院、最高人民法院、公安部1998年10月19日以高检会[1998]1号向各省、自治区、直辖市人民检察院、高级人民法院、公安厅(局)，军事检察院，军事法院，总政治部保卫部发布的《关于严禁执行刑事诉讼法关于对犯罪嫌疑人、被告人羁押期限的规定坚决纠正超期羁押问题的通知》明确：

　　对于重大、疑难、复杂的案件，羁押期限届满的，应当分别不同情况，采取果断措施依法作出处理：(1)对于流窜作案、多次作案的犯罪嫌疑人，被告人的主要罪行或某一罪行事实清楚，证据确实充分，而其他罪行一时又难以查清的，应当对已查清的主要罪行或某一罪行移送起诉、提起公诉或者进行审判;(2)对于共同犯罪案件中主犯或者从犯在逃，在押犯罪嫌疑人、被告人的犯罪事实清楚，证据确实充分的，应当对在押犯罪嫌疑人、被告人依法变更强制措施;(3)对于司法机关之间有争议的案件通过协调后意见仍不能一致的，办案单位应按照各自的职权在法定期限内依法作出处理。